Протяженность района с севера на юг 30 км, с запада на восток 40 км. Общая площадь территории составляет - 69830 га, в том числе площадь территории г. Немана - 1447 га.
Рельеф Неманского района представляет собой чередование равнинных и низменных пространств с отдельными холмисто-грядовыми возвышенностями. В районе расположены отдельные зоны с избыточным увлажнением, а низменный и равнинный рельеф, с преобладанием глинистых и суглинистых пород на поверхности способствует образованию рек, озер и болот.
Леса на территории района растут отдельными массивами и участками, крупных лесных массивов нет. Лесистость района составляет 4% территории. Наиболее крупные лесные массивы с торфяными залежами расположены на территории Жилинского сельского поселения.
На территории Лунинского сельского поселения имеются болота с незначительными залежами торфа, которые в настоящее время не разрабатываются.
В районе имеется разветвленная сеть рек и озер. Река Неман - самая полноводная и судоходная. На юго-западе Неманский район от пос. Тушино омывается рекой Шешупе. Водный бассейн района дополняет река Инструч, протекающая через пос. Маломожайское и пос. Ульяново. Для рек характерно весеннее половодье и дождевые паводки в течение года. Однако катастрофического затопления в районе нет.
Земельные ресурсы Неманского района составляют 69,83 тыс. га, из них сельскохозяйственные земельные угодья 45,5 тыс. га, земли государственного лесного фонда - 3,4 тыс. га, площадь водоемов 0,5 тыс.га.
Природными полезными ископаемыми на территории района являются минерально-сырьевые ресурсы - торф, пески, глина. Кроме этого ведутся работы по разработке месторождений и добыче нефти.
Автомобильная сеть района представлена дорогами всех административных значений, общая протяженность дорог достигает - 220 км.
- областного значения - 132 км
- местного значения - 88 км.
Железнодорожная линия, проходящая через западную часть района, обеспечивает надежную и постоянную связь с областным центром и районами области,имеет выход на магистрали Российской Федерации через пос.Чернышевское ( Нестеровский район) и Литовскую республику.
Климатические условия района определяются климатическими особенностями области. Климат области является переходным от умеренно-континентального к морскому с относительной влажностью днем - 70%, утром - 87-89 %, средней температурой в летнее время 17-18 градусов выше нуля, в зимнее время 13-14 градусов ниже нуля.